Столкнулся со случаем когда на всех сайтах и в любом браузере стала появляться всплывающая реклама, одинаковая для всех сайтов. Поначалу заметил проблему только в одном браузере и думал что троян прокрался в куки или js файлы браузера. Но более подробный анализ показал что это не так.